Internationella färjelinjer:
Zadar – Ancona, Split – Ancona, Split – Stari Grad – Pescara, Ancona – Split – Pescara samt Rijeka – Split – Stari Grad (Hvar) – Korčula – Sobra (Mljet) – Dubrovnik – Bari, Dubrovnik – Bari (direkt): Vis – Ancona, Stari Grad – Ancona.
Utom färjelinjer trafikerar även snabbåtslinjer mellan Kroatien och Italien.
Färjelinje utmed kusten:
Rijeka – Split – Stari Grad /Hvar – Korčula – Dubrovnik.
Lokala färjelinjer som förbinder fastlandet med öarna: Cres, Lošinj, Rab, Pag, Ugljan, Pašman, Olib, Silba, Premuda, Ist, Molat, Sestrunj, Rivanj, Žirje, Kaprije, Zverinac, Rava, Zlarin, Dugi otok, Iž, Šolta, Brač, Hvar, Vis, halvön Pelješac, Korčula, Lastovo och Mljet, Šipan, medan lokala fartygs- och snabbåtslinjer förbinder andra bebodda öar som saknar biltrafik.
Snabbåtslinjer (som förbinder öarna med fastlandet eller sinsemellan)
Rijekaregionen – Lošinj, Susak, Unije, Cres, Ilovik, Pag, Rab
Zadarregionen – Ist, Molat, Dugi otok, Zverinac, Sestrunj, Rivanj, Olib, Silba, Premuda
Splitregionen – Brač, Hvar, Šolta, Lastovo, Korčula, Vis
Dubrovnikregionen – Mljet, Šipan, Korčula, Lastovo
Šibenikregionen – Žirje, Kaprije
Säsongslinje: Pula – Unije – Mali Lošinj – Ilovik – Zadar
Båtlinjer (som förbinder öarna med fastlandet eller sinsemellan)
Rijekaregionen – Lošinj, Srakane, Unije, Ilovik, Susak
Zadarregionen – Dugi otok, Iž, Rava, Vrgada
Šibenikregionen – Prvić, Zlarin
Splitregionen – Drvenik Veli och Mali, Čiovo, Biševo
Dubrovnikregionen – Šipan, Lopud, Koločep.
Jadrolinija:
Det ledande kroatiska rederiet för passagerartrafik upprätthåller trafik på de flesta reguljära internationella och inhemska färje-, båt- och snabbåtslinjerna. Huvudkontoret ligger i Rijeka.
Tullstationer för insegling av främmande fartyg:
Permanenta: Umag, Poreč, Rovinj, Pula, Raša/Bršica, Rijeka, Mali Lošinj, Zadar, Šibenik, Split, Ploče, Korčula, Vela Luka, Ubli och Dubrovnik.
Under högsäsong (under sommaren): ACI marina Umag, Novigrad, Sali, Božava, Primošten, Hvar, Stari Grad (Hvar), Vis, Komiža och Cavtat.