Hrvaška je območje nadpovprečne raznolikosti, tako kopenske in morske kot podzemne, zaradi svojega posebnega geografskega položaja. Leži namreč med različnimi biogeografskimi regijami. Med 8 narodnimi parki in 11 naravnimi parki so nekateri (na primer Kopački rit pri Osijeku, Lonjsko polje v Posavini, Vransko jezero pri Pakoštanu) pod strogim nadzorom, na voljo pa so tudi pravi zoološki in botanični rezervati. Na Hrvaškem je veliko zaščitenih živalskih vrst, kot so na primer medvedi v Kutarevu, delfini in sredozemske medvedke v kvarnerskih vodah, beloglavi jastreb na Cresu ter bele štorklje v vasi Čigoč v Posavini. Tudi divji konji so na Hrvaškem našli svoje svobodno zatočišče.