Međunarodne trajektne linije
Zadar – Ancona, Split – Ancona, Split – Stari Grad – Pescara, Ancona – Split – Pescara te Rijeka – Split – Stari Grad (Hvar) – Korčula – Sobra (Mljet) – Dubrovnik – Bari
Dubrovnik – Bari (izravno): Vis – Ancona, Stari Grad – Ancona
Osim trajektnih, između Hrvatske i Italije prometuju i brzobrodske linije.
Trajektne linije duž obale
Rijeka – Split – Stari Grad/Hvar – Korčula – Dubrovnik
Lokalne trajektne linije povezuju s kopnom otoke: Cres, Lošinj, Rab, Pag, Ugljan, Pašman, Olib, Silbu, Premudu, Ist, Molat, Sestrunj, Rivanj, Žirje, Kaprije, Zverinac, Ravu, Zlarin, Dugi otok, Iž, Šoltu, Brač, Hvar, Vis, poluotok Pelješac, Korčulu, Lastovo i Mljet, Šipan, a lokalne brodske i brzobrodske linije povezuju druge naseljene otoke na kojima nema automobilskog prometa.
Brzobrodske linije (veza s kopnom ili među otocima)
Riječko okružje – Lošinj, Susak, Unije, Cres, Ilovik, Pag, Rab
Zadarsko okružje – Ist, Molat, Dugi otok, Zverinac, Sestrunj, Rivanj, Olib, Silba, Premuda
Splitsko okružje – Brač, Hvar, Šolta, Lastovo, Korčula, Vis
Dubrovačko okružje – Mljet, Šipan, Korčula, Lastovo
Šibensko okružje – Žirje, Kaprije
Sezonska linija: Pula – Unije – Mali Lošinj – Ilovik – Zadar.
Brodske linije (veza s kopnom ili među otocima)
Riječko okružje – Lošinj, Srakane, Unije, Ilovik, Susak
Zadarsko okružje – Dugi otok, Iž, Rava, Vrgada
Šibensko okružje – Prvić, Zlarin
Splitsko okružje – Drvenik Veli i Mali, Čiovo, Biševo
Dubrovačko okružje – Šipan, Lopud, Koločep.
Jadrolinija
Glavni hrvatski putnički brodar održava najveći broj redovitih, međunarodnih i domaćih trajektnih, brodskih i brzobrodskih linija. Glavni je ured u Rijeci.
Carinske ispostave za ulazak stranih brodova
Stalne: Umag, Poreč, Rovinj, Pula, Raša/Bršica, Rijeka, Mali Lošinj, Zadar, Šibenik, Split, Ploče, Korčula, Vela Luka, Ubli i Dubrovnik.
Sezonske (u tijeku ljetne sezone): ACI marina Umag, Novigrad, Sali, Božava, Primošten, Hvar, Stari Grad (Hvar), Vis, Komiža i Cavtat.