Wat aantal en verscheidenheid aan flora betreft valt Kroatië onder de rijkste landen van Europa, met op sommige locaties tot wel 3000 plantensoorten, zoals op Velebit en de Kvarnereilanden. Zo’n verscheidenheid is uiterst zeldzaam, zeker in een klein land zoals Kroatië. De ongerepte groene landschappen van Gorski Kotar en Lika, en in het zuiden van Istrië zijn van uitzonderlijke ecologische waarde en de concentratie aan beschermde natuurparken zijn van onschatbare waarde voor de talloze endemische soorten. En voor de liefhebbers van orchideeën: in het uiterste zuiden van Istrië, tussen vele andere soorten orchideeën, groeit een bijzondere endemische Istrische soort Serapias (serapias istraca), die tot nu toe nergens anders is gevonden.