I Kroatien er der internationale lufthavne i Zagreb, Split, Dubrovnik, Osijek, Zadar, Rijeka og Pula, mens lufthavnene på Brač og Lošinj kun er åbne i sommersæsonen.
Croatia Airlines, det kroatiske nationale flyselskab, forbinder Kroatien med talrige europæiske byer. Sammen med Croatia Airlines opretholdes luftfartsforbindelserne til Kroatien af yderligere 35 luftfartsselskaber så som British Airways, Germanwings, Lufthansa, SkyService Airline, Iberia, Sterling, SAS, Delta, TAP Portugal og Austrian Airlines m.fl..
Hvis man selv vil flyve og lande i kroatisk luftområde, er det nødvendigt at have en tilladelse, som udstedes efter anmodning.
En sådan anmodning om tilladelse til at bevæge sig i det kroatiske luftrum skal indeholde følgende oplysninger:
- tidstabel for flyvningen (sendes til alle flykontroller, som har brug for den)
- formålet med flyvningen
- flyvestatus
- navn på flyets ejer eller flyselskabet, samt ejerens eller selskabets adresse
Flyvetilladelse for fly i mellemkategorien op til 10 sæder, samt fly på over 10 passagersæder, udstedes af Afdelingen for flyvetilladelser i Ministeriet for navigation, trafik og kommunikation, som kan kontaktes på denne adresse.
Kontoret for flyvetilladelser
Prisavlje 14
10000 Zagreb
Tel. +385(0)1 616 90 74
Fax. +385(0)1 619 63 93
Afdelingen for flyvetilladelser kan yderligere af flyejeren eller flyselskabet kræve et bevis på registrering af flyet i det land, som ejeren eller selskabet kommer fra (hvis der er tvivl om, hvorvidt dette land er medlem af organisation ICAO). For fly i tung- og mellemkategorien med mere end 10 passagersæder, kræver Ministeriet for navigation, transport og kommunikation, at man foruden anmodning om flyvning eller landing vedlægger forsikringspolicenummer og oplysning om flyets værdi.
Fly i let- og mellemkategorien med mindre end 10 passagersæder skal have alle nødvendige dokumenter ombord på flyet og vise dem til de kompetente personer på forlangende. Anmodninger om flyvning og landing i kroatisk luftrum for fly i tung- og mellemkategorien skal afleveres senest to arbejdsdage før den planlagte flyvning. Anmodninger om flyvning for fly i let- og mellemkategorien med mindre end 10 passagersæder skal afleveres med formularen med flyvetidstabellen senest en time før flyvningen, eller når man kommer ind i Republikken Kroatiens luftrum.