På grund af antallet af arter og deres mangfoldighed regnes Kroatiens flora blandt de rigeste i Europa. En sådan mangfoldighed,visse steder med næsten 3.000 plantearter, f.eks. på Velebit bjerget og Kvarner øerne, findes yderst sjældent andre steder i verden; især på et så lille geografisk område. De uberørte grønne områder, Gorski kotar og Lika, eller Istriens syd, er i kraft af deres særligt høje økologiske værdi og antallet af beskyttede naturparker, velbevarede skatkamre for et stort antal arter, såkaldte endemiske arter, som globalt set kun findes der. For elskere af orkideer – en særlig bemærkning: på den sydligste spids af Istrien, vokser blandt mange andre orkidearter, også en særlig endemisk, istrisk art, (på latin: serapias istriaca), som indtil nu kun er blevet fundet her.