Mezinárodní trajektové linky:
Zadar-Ancona; Split-Ancona; Split-Stari Grad-Pescara, Ancona Split-Pescara a Rijeka-Split-Stari Grad (Hvar)-Korčula-Sobra (Mljet) –Dubrovnik-Bari
Dubrovník-Bari (přímo), Vis-Ancona, Stari Grad-Ancona
Trajektové linky podél pobřeží:
Rijeka-Split-Stari Grad/Hvar-Korčula-Dubrovník.
Lokální trajektové linky spojují s pevninou ostrovy: Cres, Lošinj, Rab, Pag, Ugljan, Pašman, Olib, Silbu, Premudu, Ist, Molat, Sestrunj, Rivanj, Žirje, Kaprije, Zverinac, Ravu, Zlarin, Dugi otok, Iž, Šoltu, Brač, Hvar, Vis, poloostrov Pelješac, Korčulu, Lastovo, Mljet, Šipan a místní lodní a rychlé lodní linky spojují ostatní osídlené ostrovy, na kterých není automobilová doprava.
Rychlé lodní linky (spojení s pevninou nebo mezi ostrovy):
Rijecká oblast: Lošinj, Susak, Unie, Cres, Ilovik, Pag, Rab
Zadarská oblast: Ist, Molat, Dugi otok, Zverinac, Sestrunj, Rivanj, Olib, Silba, Premuda
Splitská oblast: Brač, Hvar, Šolta, Lastovo, Korčula, Vis
Dubrovnická oblast: Mljet, Šipan, Korčula, Lastovo
Šibenická oblast: Kaprije, Žirje
Lodní linky spojují s pevninou nebo vzájemně následující ostrovy:
Rijecká oblast: Lošinj, Srakane, Unije, Ilovik, Susak
Zadarská oblast: Dugi otok, Iž, Rava, Vrgada
Šibenická oblast: Prvić, Zlarin
Splitská oblast: Drvenik Veli a Mali, Čiovo, Biševo
Dubrovnická oblast: Šipan, Lopud, Koločep
Jadrolinija:
Hlavní chorvatský osobní lodní přepravce, provozuje převážnou většinu pravidelných mezinárodních a domácích trajektových, lodních a rychlých lodních linek. Hlavní úřad je v Rijece.
Celní pobočky pro vstup cizích lodí jsou:
Celoroční: Umag, Poreč, Rovinj, Pula, Raša (Bršica), Rijeka, Mali Lošinj, Zadar, Šibenik, Split, Ploče, Korčula, Vela Luka, Ubli a Dubrovník.
Sezónní (po dobu letní sezóny): ACI marina Umag, Novigrad, Sali, Božava, Primošten, Hvar, Stari Grad (Hvar), Vis, Komiža a Cavtat.